CEMAVE
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Centro Nacional de Pesquisa e Conservação de Aves Silvestres
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Resultados da Pesquisa
Item Sampling guidelines to assess plastic ingestion in ACAP species(ACAP, 2020) Uhart, Marcela; Gallo, Luciana; Serafini, Patricia PereiraThese guidelines provide a standardized approach for sampling ACAP species to assess plastic ingestion (macro and microplastics, as well as chemical compounds) with an array of sample type choices that should enable collection in diverse settings. Samples can be collected from dead beached or by-caught specimens, live and dead animals in breeding sites or rehabilitation centres, as well as non-invasively by sampling fresh scats from nests, regurgitated boluses or unviable or hatched eggs. Given the particular susceptibility of ACAP species to plastic ingestion and the increasing prevalence of this problem worldwide, collecting samples to assess plastic ingestion should be considered whenever an opportunity presents. Using standardized protocols increases the consistency and representativeness of results and allows comparisons between species and detection of large-scale spatiotemporal patterns. Target research and surveillance options include: 1. Macroplastics (>5mm): can be assessed from stomach contents in dead birds, regurgitates in live birds, and boluses. 2. Microplastics (<5mm): can be assessed from gastrointestinal contents in dead birds, live-bird regurgitates, faeces/guano and boluses. 3. Plastic-derived chemicals (additives): can be assessed in tissues/organs (e.g. liver, muscle, fat) in dead birds, and preen gland oil, stomach oil and plastic items recovered from live and/or dead birds. Additives can also be found in hatched and/or unviable eggs. 4. Plastic-adsorbed organic contaminants (e.g. PCBs -polychlorinated biphenyls- and POCs -organochlorine pesticides-): can be assessed in plastic items found in the gastrointestinal tract of dead birds or regurgitates in live birds.Item Staphylococcus sciuri as a Reservoir of mecA to Staphylococcus aureus in Non-Migratory Seabirds from a Remote Oceanic Island(Microbial Drug Resistance, 2021) Saraiva, Mauro de Mesquita Souza; de Leon, Candice Maria Cardoso Gomes; Silva, Núbia Michelle Vieira da; Raso, Tânia Freitas; Serafini, Patricia Pereira; Givisiez, Patricia Emilia Naves; Gebreyes, Wondwossen Abebe; Oliveira, Celso José Bruno deAim: Genomic analysis of a methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strain cultured from a non-migratory seabird at Fernando de Noronha Archipelago (Brazilian oceanic islands) was carried out to investigate the potential origin of MRSA genetic determinants in an ecological setting with minimal or absent antimicrobial selective pressure, and minimal interaction with humans and domestic animals. Results: The study determined mecA gene homology and the phylogenetic relatedness with mecA described in Staphylococcus sciuri, which was the major Staphylococcus spp. cultured from the birds. Our findings corroborate in silico assumptions that the mecA gene in MRSA strains clinically relevant for humans and animals originates from S. sciuri ancestors. Conclusion: Coagulase-negative staphylococci seem to be natural reservoirs of methicillin-resistant genes to S. aureus, even in environments with very low antimicrobial selection pressure.Item Interactive Machine Learning Solutions for Acoustic Monitoring of Animal Wildlife in Biosphere Reserves(2023) Gouvêa, Thiago S.; Kath, Hannes; Troshani, Ilira; Luers, Bengt; Serafini, Patricia Pereira; Campos, Ivan B.; Afonso, Andre S.; Leandro, Sergio M. F. M.; Swanepoel, Lourens; Theron, Nicholas; Swemmer, Anthony M.; Sonntag, DanielBiodiversity loss is taking place at accelerated rates globally, and a business-as-usual trajectory will lead to missing internationally established conservation goals. Biosphere reserves are sites designed to be of global signifcance in terms of both the biodiversity within them and their potential for sustainable development, and are therefore ideal places for the development of local solutions to global challenges. While the protection of biodiversity is a primary goal of biosphere reserves, adequate information on the state and trends of biodiversity remains a critical gap for adaptive management in biosphere reserves. Passive acous tic monitoring (PAM) is an increasingly popular method for continued, reproducible, scalable, and cost-effective monitoring of animal wildlife. PAM adoption is on the rise, but its data management and analysis requirements pose a barrier for adoption for most agencies tasked with monitoring biodiversity. As an interdisciplinary team of machine learn ing scientists and ecologists experienced with PAM and working at biosphere reserves in marine and terrestrial ecosystems on three different continents, we report on the co-development of interactive machine learning tools for semi-automated assessment of animal wildlife.- Considerações de biossegurança para atividades de campo (Reabilitação de Procellariiformes (albatrozes, petréis e pardelas))(Comunnicar, 2020) Serafini, Patricia Pereira
- Microbiota cloacal e de orofaringe de cardeais-amarelos (Gubernatrix cristata) de cativeiro e de vida livre(2019) Silva, Bianca Ressetti da; Serafini, Patricia Pereira; Chiarani, Eduardo; Silva, Thaiane Weinert da; Fontana, Carla Suertegaray; Meurer, Rafael; Dittrich, Rosangela LocatelliO cardeal-amarelo, Gubernatrix cristata (Vieillot, 1817), está criticamente ameaçado de extinção no Brasil, onde restam cerca de 50 indivíduos de vida livre. Informações sobre a microbiota dessas aves são importantes para avaliação sanitária dos indivíduos cativos e silvestres, embasando planos de conservação. O presente estudo avaliou a microbiota cloacal e de orofaringe de cardeais-amarelos do Programa de Cativeiro do Cardeal-amarelo (PCCA) e de vida livre. Foram coletadas amostras de nove cardeais-amarelos cativos e de um indivíduo silvestre, o qual foi capturado com rede de neblina no Parque Estadual do Espinilho (Barra do Quaraí, RS). Amostras de microbiota cloacal e de orofaringe dos 10 cardeais-amarelos foram obtidas utilizando suabes uretrais estéreis, armazenadas em meio Stuart e acondicionadas entre 2 a 8º C imediatamente após a coleta. As análises microbiológicas foram realizadas em laboratório na Estação Ecológica de Carijós/ICMBio seguindo metodologia padronizada. Para identificação das enterobactérias foi utilizado o kit comercial API20E (bioMérieux) seguindo as instruções do fabricante. Foram isoladas 15 colônias de bactérias, com predominância de bactérias gram-positivas (n = 13; 86,7%) do gênero Staphylococcus sp. e duas espécies de bactérias gram-negativas (13,3%), uma identificada como Enterobacter cloacae, de amostra cloacal, e outra como Escherichia coli, de amostra de orofaringe. Entender a microbiota do sistema gastrointestinal dessas aves é importante para relacionar a presença de microrganismos e doenças infecciosas, além de estabelecer parâmetros normais ainda não existentes para a espécie.
- Caracterização dos padrões de mudas em aves de Santa Catarina, Brasil(2020) Ferreira, Ariane; Johnson, Erik I.; Meurer, Rafael; Sandri, Sandro; Serafini, Patricia Pereira; Rocha, Luis O. F. da; Souza Júnior, Silvio de; Assumpção, Cristiana C. A.; Lugarini, CamileDeterminar idade e sexo de aves a partir da muda e plumagem é uma ferramenta para monitoramento populacional demográfico, de estruturação de populações e de biologia reprodutiva. O objetivo deste estudo foi determinar o sexo e a idade de aves de ambientes florestais, observando o período em que realizam os eventos fundamentais para seus ciclos de vida, como a muda e a reprodução. Para isto, as aves foram capturadas com redes de neblina instaladas no sub-bosque e áreas abertas, em ex pedições mensais entre 2016-2019 em duas unidades de conservação (UC), na ilha de Santa Catarina e Arvoredo. A amostragem iniciou-se ao amanhecer, com no mínimo 5h de esforço/dia, por dois dias consecutivos. As revisões das redes foram realizadas a cada 30 minutos e as aves capturadas acondicionadas em sacos de transporte. Cada ave foi contida manualmente, marcada com anilha CEMAVE e solta imediatamente após o processamento. A estratégia e extensão de muda foi verificada para cinquenta e sete espécies pertencentes a vinte e uma famílias (n=1280), determinando-se a idade de acordo com o sistema W-R-P modificado, e incluindo aqui informações de aves apreendidas e atropeladas no entorno da UC. O primeiro ciclo de mudas foi definido como o período entre o início da primeira e a segunda muda pré- básica, e os ciclos definitivos foram definidos quando as plumagens se tornaram homólogas.
- Valores hematológicos e bioquímicos de referência para atobá-marrom (Sula leucogaster) em área de distribuição no sul do Brasil(2018) Serafini, Patricia Pereira; Meurer, Rafael; Bergman, Bruna; Kolesnikovas, Cristiane K. M.; Foletto, VanessaOs exames hematológicos e parâmetros bioquímicos séricos fornecem informações para avaliação da saúde e diagnóstico de doenças nas aves, além de subsidiar decisões importantes de manejo tal como a translocação após processo de resgate e reabilitação. No entanto, a literatura que descreve valores hematológicos e bioquímicos séricos de aves selvagens livres e, mesmo mantidas em cativeiro, é muito escassa. Esta falta de dados padronizados que podem ser utilizados para avaliar a saúde das aves limita o diagnóstico adequado. Neste contexto, o presente estudo estabelece intervalos de referência para Atobá-marrom (Sula leucogaster). As amostras foram obtidas a partir de animais encontrados nas praias ou encaminhados para reabilitação durante o monitoramento da região da Ilha de Santa Catarina, ocorrido no escopo do Projeto de Monitoramento de Praias da Petrobrás/ Bacia de Santos, realizado pela Associação R3 Animal. As coletas de sangue foram realizadas pela venopunção da veia ulnar ou jugular, na qual foi obtido, no máximo, 1% do peso corporal de sangue de cada ave. A contagem total de eritrócitos, leucócitos e trombócitos, foi realizada em câmara de Neubauer no sangue previamente diluído (1:200) em solução Natt & Herrick's (1952). O hematócrito foi determinado pelo método do microhematócrito, com centrifugação a 12.000 rpm por 5 minutos. A extensão sanguínea foi corada com o corante Instantprov corante rápido para hematologia (Newprov®) e possibilitou a contagem diferencial relativa de leucócitos, além disso foram avaliadas a presença de corpúsculos de inclusão ou parasitas, em microscopia óptica. Os testes bioquímicos foram realizados a partir da centrifugação das amostras, onde o sobrenadante, soro ou plasma, foi transferido para um tubo separado, submetido a reagentes líquidos (Labtest®), de acordo com instruções do fabricante, e lidos por espectrofotometria. Os valores foram obtidos de aves consideradas aptas para soltura através da análise dos resultados dos exames físicos, hematológicos e bioquímicos, durante o processo de reabilitação. Sendo assim, os valores de intervalos de referência (n = 49) observados na análise hematológica de eritrograma foram: volume globular (31,9-45,2 %), hematimetria (1,5-2,2 109/µL), hemoglobina (32,8-50,2 g/dL), e para o leucograma: heterófilos (23,7-97,1 %), monócitos (0-25,1 %), linfócitos (2,3-52,4 %), trombócitos (932,3-6.688,2 µL), eosinófilos (0-10%), basófilos (0%), leucócitos (681,3-14491,1 µL). Para análise bioquímica foram apresentados valores de intervalos de referência para: proteínas totais (3,6-5,6 g/dL), glicose (173,6-323,6 mg/dL), ácido úrico (1,8-8,7 mg/dL), creatinina (259,6-2.126,8 mg/dL), triglicérides (30,4-275,1 mg/dL), albumina (1,1-1,7 g/dL), fosfatase alcalina (2,6-79,5 U/L), fósforo (2,0-7,9 mg/dL) e cálcio (7,0-12,8 mg/dL). Este trabalho atende à lacuna importante do conhecimento sobre parâmetros para avaliação da saúde das populações da espécie foco do estudo e da sua importância para embasar ações de manejo in-situ e ex-situ. Além disso, consideramos que padrões hematológicos e bioquímicos também podem ser muito úteis para a identificação e monitoramento de impactos de atividades antrópicas sobre a biodiversidade e para monitorar medidas de mitigação que afetem espécies da fauna ameaçada.
- Estratégia e extensão de muda de passeriformes em unidades de conservação da Ilha de Santa Catarina e Arvoredo, Santa Catarina(2018) Ferreira, Ariane; Lugarini, Camile; Johnson, Erik I.; Serafini, Patricia Pereira; Meurer, Rafael; Sandri, Sandro; Rocha, Luis O. F. da; Souza, Silvio de S. J.; Assumpção, Cristiana C. A.Determinar idade e sexo de aves a partir da muda e plumagem é uma ferramenta para monitoramento populacional demográfico, de estruturação de populações e de biologia reprodutiva. O objetivo deste estudo foi determinar o sexo e a idade de Passeriformes, observando o período em que realizam eventos cíclicos importantes, como muda e reprodução. Para isto, as aves foram capturadas com redes de neblina instaladas no sub-bosque e áreas abertas, em expedições mensais entre 2016 e 2018, em duas unidades de conservação, na ilha de Santa Catarina e Arvoredo. Cada ave foi contida manualmente, marcada com anilha CEMAVE e solta imediatamente após o processamento. A estratégia e extensão de muda foi determinada para quatro espécies das famílias Tyrannidae, Turdidae e Thraupidae, determinando-se a idade de acordo com o sistema W R-P modificado. O primeiro ciclo de mudas foi definido como o período entre o início da primeira e a segunda muda pré-básica e os ciclos seguintes, com ciclos definitivos quando as plumagens se tornaram homólogas. A estação reprodutiva iniciou-se na primavera austral reduzindo durante o verão, sendo que 39,3% dos indivíduos capturados (n = 743) exibiram placa de incubação (PI) e protuberância cloacal (PC) neste período. Elaenia obscura (n = 76) seguiu a estratégia básica complexa (EBC) com muda pré-formativa (FPF) parcial (43,75%), incompleta (25%) e excêntrica (18,75%), sendo caracterizada pela retenção de todas as coberteiras primárias (pp covs), substituição de algumas (28,6%) ou todas (71,4%) as grandes coberteiras (gr covs), álulas (1,2), terciárias (s9) e penas de contorno. Três espécimes de E. obscura apresentaram um padrão atípico, com muda incompleta excêntrica, substituindo penas primárias (0-4) e secundárias de voo (0-5) e algumas (1-3) pp covs externas. Turdus amaurochalinus (n = 74) e T. albicollis (n = 7) seguiram a EBC, com FPF caracterizada pela substituição de todas as penas de corpo, pequenas e médias coberteiras, álulas (20,0%) e 2-8 (3,6±1,9) gr covs internas. Turdus juvenis foram facilmente identificados pela presença de manchas ferrugíneas nas penas do peito, cabeça e coberteiras das asas, além de evidente comissura no bico e ossificação incompleta do crânio (42%). Um espécime de T. amaurochalinus apresentou FPF incompleta excêntrica substituindo primárias (p7-10), juntamente com 2 pp covs, todas as álulas e secundárias de voo. Tachyphonus coronatus (n=28) também seguiu a EBC, porém com FPF completa, substituindo todas as penas de contorno e voo; os machos trocaram suas penas marrons para preta na FPF, enquanto fêmeas permaneceram com a mesma coloração (marrom) em todos os ciclos. A existência de muda limitada, restrita apenas a alguns indivíduos de uma espécie, antecedendo a reprodução, pode indicar muda pré-alterna. Apesar de não ter sido descrita em E. obscura, 9,2% dos indivíduos capturados neste estudo apresentaram muda de contorno sobreposta à PC ou PI, entre os meses de agosto e dezembro, podendo ser decorrente de muda pré-alterna ou adventícia, merecendo melhor documentação. Outras espécies não apresentaram muda com sobreposição ao início da reprodução. Para as quatro espécies descritas neste estudo foi possível reconhecer aves do primeiro ciclo de vida, auxiliando o monitoramento da dinâmica populacional de aves terrestres em unidades de conservação em ilhas de Santa Catarina, a partir de critérios precisos.
- Valores hematológicos e bioquímicos de referência para Tesourão (Fregata magnificens) em área de distribuição no sul do Brasil(2019) Rezende, Saloá Teixeira; Meurer, Rafael; Kolesnikovas, Cristiane K. M.; Serafini, Patricia PereiraNo Brasil ocorrem três espécies de fragatas, sendo Fregata magnificens a que possui distribuição geográfica mais ampla. Este estudo estabelece intervalos de valores de referência hematológicos e bioquímicos para área de distribuição desta espécie no sul do país, informações necessárias para a avaliação da saúde e para subsidiar decisões de manejo. Amostras foram coletadas de aves aptas para a soltura da região da Ilha de Santa Catarina, pelo Projeto de Monitoramento de Praias da Petrobras/Bacia de Santos, realizado pela Associação R3 Animal. O hematócrito foi determinado por microhematócrito, por centrifugação a 12.000 rpm por 5 minutos. A contagem total de eritrócitos, leucócitos e trombócitos foi realizada em Câmara de Neubauer. A contagem diferencial relativa de leucócitos utilizou microscopia ótica e esfregaço sanguíneo corado com Instantprov (Newprov®). Realizou-se os testes bioquímicos a partir do soro das amostras submetido a diferentes reagentes líquidos e lido por espectrofotometria. As análises estatísticas foram feitas com Reference Value Advisor V 2.1 e Microsoft Office Excel®. Os valores dos intervalos de referência (n=24) obtidos foram: volume globular (34,6-48,3%), hemoglobina (29,3-54,0g/dL), leucócitos (842,4-16242,4µL), trombócitos (806,6-7738,3µL), hematimetria (1,3-3,1µL), heterófilos (55,2-97,8%), monócitos (0-13%), eosinófilos (0-3%), linfócitos (3,5-81,6%), basófilos (0-1%), proteínas totais (2,4-6g/dL), glicose (114,7-365,6mg/dL), triglicérides (28,8-119,1mg/dL), albumina (0,6-2,2g/dL), ácido úrico (1-12mg/dL), cálcio (3,2- 15,7mg/dL), creatinina (600,6-2086,1mg/dL), fosfatase alcalina (3,9-50,1U/L) e fósforo (2,8-6,4mg/dL). Assim, este estudo preenche lacuna de conhecimento referente aos valores de referência para Fregata magnificens.
- Parâmetros leucocitários e hemoparasitas de cardeal-amarelo (Gubernatrix cristata) de cativeiro e de vida livre(2019) Silva, Bianca Ressetti da; Mello, Barbara Correa; Silva, Natalie Stephanie da; Serafini, Patricia Pereira; Chiarani, Eduardo; Silva, Thaiane Weinert da; Fontana, Carla Suertegaray; Dittrich, Rosangela LocatelliRestam cerca de 50 cardeais-amarelos, Gubernatrix cristata (Vieillot, 1817), de vida livre no Brasil (espécie criticamente ameaçada), não havendo valores de referência para monitoramento sanitário das populações. O presente estudo avaliou a morfologia das células sanguíneas, parâmetros leucocitários (diferencial) e presença de hemoparasitas em cardeais-amarelos do Programa de Cativeiro do Cardeal-amarelo (PCCA) e de vida livre. Foram coletadas amostras de 19 cardeais-amarelos do PCCA e de um indivíduo silvestre capturado com rede de neblina no Parque Estadual do Espinilho. Amostras de sangue foram obtidas da veia ulnar para confecção imediata das extensões sanguíneas. As lâminas foram coradas pela técnica de May Grünwald Giemsa. No diferencial de leucócitos dos cardeais-amarelos cativos, o número de heterófilos variou de 21 a 83, linfócitos de 11 a 78, monócitos de 01 a 48, basófilos de zero a 21, eosinófilos de zero a 09, e heterófilos bastonetes de zero a 04. Os policromatófilos variaram de 02 a 45 por campo. Na leitura do esfregaço do cardeal-amarelo silvestre, foram contados 23 heterófilos, 27 linfócitos, 20 monócitos, 29 basófilos, 01 eosinófilo, zero heterófilos bastonetes, e 09 policromatófilos por campo. No esfregaço do cardeal-amarelo silvestre e de 08 indivíduos cativos (42,1 %) observaram-se inclusões citoplasmáticas nos linfócitos. Hemoparasitas foram observados no esfregaço de apenas um cardeal-amarelo do PCCA, onde foram identificadas 57 microfilárias. Esses resultados são importantes para avaliação de estresse, resposta inflamatória e doenças, contribuindo para a conservação.